「なぜ人類誕生の瞬間は、空白のままなのか。」プロメテウス　にゃに見てんださんの映画レビュー（感想・評価）

小生の理解している限りで、ご疑問にお答えします。

＞なぜ最初にエンジニアは黒い液体を飲んだんでしょうか？

地球という天体にエンジニアのDNAをもたらすためですね。その結果、人間はエンジニアと同じDNAを持っている訳です。なぜ、そんなことをしたか？　地球をエンジニアと同じ動物の棲む惑星にしたかったからでしょうね。

＞デヴィッドがホロウェイに黒い液体をなぜ飲ませた？

デヴィッドは『エイリアン』第１作から続く悪意あるアンドロイドの延長線にいる存在です。
これまでアンドロイドは地球にエイリアンを持ち帰ろうとしていましたが、本作の場合、個人的な人間不信から興味本位で人間をエイリアンの実験媒体としていることが、次回作『コヴェナント』で明らかになります。

＞なぜファイフィールドは凶暴化した？

エイリアンの形態は次々に変化しているのですが、この段階では宿主に取り憑く存在だったということでしょう。